- Năm 1956, Viện Khảo sát thiết kế Thủy lợi - Thủy điện Hà Nội (Tiền thân của công ty) được thành lập. Từ đó đến nay, công ty đã nhiều lần đổi tên để phù hợp với chức năng, nhiệm vụ và nhu cầu phát triển sự nghiệp thủy lợi của đất nước trong từng giai đoạn.
- Tháng 2/1993, Viện khảo sát thiết kế Thủy lợi Nam Bộ sau khi được tách ra từ Viện Khảo sát thiết kế Thủy lợi - Thủy điện Hà Nội, được đổi tên thành Công ty Khảo sát Thiết kế Thủy lợi II theo Quyết định số 67/QĐ-TCCB của Bộ Thủy lợi.
- Tháng 9/1995, công ty đổi tên thành Công ty Tư vấn Xây dựng Thủy lợi II.
- Năm 2004, công ty được cổ phần hóa.
+ Ngày 29/11/2004, công ty tiến hành bán đấu giá cổ phiếu với số lượng cổ phiếu đấu giá thành công là 17.320 cổ phiếu, giá đấu thành công cao nhất là 123.000 đồng/cp, giá đấu thành công thấp nhất là 101.000 đồng/cp và giá đấu thành công bình quân là 102.173 đồng/cp.
+ Ngày 29/12/2004, công ty chính thức đi vào hoạt động kinh doanh theo cơ chế công ty cổ phần với vốn điều lệ 15 tỷ đồng, trong đó Nhà nước nắm giữ 30%.

- Xây dựng công trình kỹ thuật dân dụng;
- Hoạt động kiến trúc và tư vấn kỹ thuật có liên quan;
- Buôn bán vật liệu, thiết bị lắp đặt khác trong xây dựng.

HECII là một trong những công ty đứng đầu ở Việt Nam có hơn 30 năm kinh nghiệm trong lĩnh vực tư vấn xây dựng thủy lợi, khảo sát địa hình, địa chất và xử lý nền móng sử dụng khoan phụt, thi công tường tâm Cement - Bentonit và ứng dụng những kỹ thuật tiên tiến khác;...
Vốn điều lệ hiện tại của công ty là 42 tỷ đồng, có thể xem đây là mức vốn khá cao đối với công ty hoạt động trong lĩnh vực thiết kế.
Thị trường chiến lược của công ty là các tỉnh, địa phương có nhu cầu về nguồn nước tưới phục vụ nông nghiệp, cây công nghiệp, nước sinh hoạt và công nghiệp, phát điện bằng thủy năng; các tỉnh, địa phương có địa lý để xây dựng được các hồ chứa nước tạo nguồn phục vụ cho nhu cầu thủy lợi và thủy điện như các tỉnh Đông Nam Bộ, miền Trung, Tây Nguyên; các tỉnh có nhu cầu ngăn mặn, rửa phèn chua, thoát lũ,... như các tỉnh ĐBSCL.

Các mục tiêu chủ yếu của công ty:
- Công ty luôn xác định sứ mệnh của công ty là "Phát triển bền vững thủy lợi và cơ sở hạ tầng"
- Huy động và sử dụng có hiệu quả nguồn vốn cho hoạt động kinh doanh, đầu tư nhằm tối đa hóa lợi ích cho các cổ đông, tạo công ăn việc làm ổn định cho người lao động, thực hiện nghĩa vụ thuế và các nghĩa vụ tài chính khác theo quy định pháp luật.
Chiến lược phát triển trung và dài hạn:
- Đối với hoạt động tư vấn - khảo sát - thiết kế: phát triển công ty trở thành một đơn vị dẫn đầu cả nước về lĩnh vực tư vấn thủy lợi, mở rộng thị trường ra các thị trường các nước lân cận.
- Mở rộng thị trường về công nghệ khoan phụt xi măng đất Jet grounting, CDM, CDMS.
- Đối với hoạt động đầu tư: Tập trung vào lĩnh vực đầu tư dự án Thủy điện, cùng với mở rộng đầu tư xây dựng văn phòng làm việc và đầu tư tài chính khác.
Các mục tiêu đối với môi trường, xã hội và cộng đồng của công ty:
- Sản phẩm của công ty làm ra luôn phải thỏa mãn tất cả những tiêu chí BVTM.
- Về mục tiêu xã hội, cộng đồng: Đặt mục tiêu chăm lo, đóng góp và chung tay gánh vác cho cộng đồng theo khả năng cao nhất của công ty.